日本海上保安发言人浅野正志向法新社证实，日本海上保安厅发言人称，中国“科学”号科考船在9月27日首次被发现出现在日本最南端冲绳县石垣岛以北约70公里海域，这位发言人说，这艘船“不时地从船舷和船尾向海中伸出类似缆线的物体”。
该发言人指出，日本海上保安厅随后通过无线电向该船发出信息，要求其停止行动并明确表示未经日本方面同意，不允许在日本相关海域展开科学研究，该船最终于10月2日驶离。
这位发言人指出，今年中国船只未经许可在日本专属经济区开展海洋调查的次数，已比去年同期增加了一倍以上。
根据《联合国海洋法公约》规定，海上专属经济区是距一国海岸线200海里范围内的区域，如果要进行科学研究，须经拥有勘探和开发自然资源专属权的国家同意。
日本海上保安发言人浅野先生指出，自日本和菲律宾于5月28日宣布将就海上边界问题展开谈判以来，未经授权的中国船只在日本专属经济区内进行研究出现频率“激增”，今年已记录在案的此类案件达14起，而去年为6起，此前三年每年仅有1至2起。
尽管国际仲裁法庭裁定北京对南海的几乎全部的主权要求缺乏法律依据，但北京仍声称对南海大部分海域拥有主权。
中国海警与菲律宾海警近期多次发生冲突，引发了人们对该有争议海域发生冲突的担忧。
此外，日本和中国的海警船经常在日本称的尖阁诸岛附近发生对峙。这些岛屿由东京实际管辖，但北京声称对其拥有主权，称其为钓鱼岛。