日本海上保安廳發言人淺野正志向法新社證實，日本海上保安廳發言人稱，中國「科學」號科考船於9月27日首度被發現出現在日本最南端的沖繩縣石垣島以北約70公里海域，這位發言人說，這艘船「不時地從船舷和船尾向海中伸出類似纜線的物體」。
這位發言人指出，日本海上保安廳隨後透過無線電向該船發出訊息，要求其停止行動並明確表示未經日本方面同意，不允許在日本相關海域展開科學研究，該船最終於10月2日駛離。
這位發言人指出，今年中國船隻未經許可在日本專屬經濟區展開海洋調查的次數，已比去年同期增加了一倍以上。
根據《聯合國海洋法公約》規定，海上專屬經濟區是距離一國海岸線200海浬範圍內的區域，若要進行科學研究，須經擁有探勘和開發自然資源專屬權的國家同意。
日本海上保安廳發言人淺野先生指出，自日本和菲律賓於5月28日宣布將就海上邊界問題展開談判以來，未經授權的中國船隻在日本專屬經濟區內進行研究出現頻率「激增」，今年已記錄在案的此類案件達14起，而去年為6起，此前三年每年僅有1至2起。
儘管國際仲裁法庭裁定北京對南海的幾乎全部主權要求缺乏法律依據，但北京仍聲稱對南海大部分海域擁有主權。
中國海警與菲律賓海警近期多次發生衝突，引發了人們對該爭議海域發生衝突的擔憂。
此外，日本和中國的海警船經常在日本稱的尖閣諸島附近發生對峙。這些島嶼由東京實際管轄，但北京聲稱對其擁有主權，稱其為釣魚台。